Das Pfarrdorf Könghausen liegt vier Kilometer nordöstlich des Hauptortes Eppishausen. Der Ort wurde Ende des 11. Jahrhunderts erstmals genannt als „in Kenginshuosin“. Der Ortsname hat sich seit den ersten geschichtlichen Überlieferungen oftmals verändert.

Zur ehemals selbstständigen Gemeinde Könghausen gehörten die Ortsteile Aufhof, Ellenried, Klenkerhof, Lutzenberg und Weißenhof.

Die gesamte Gemeinde wurde im Zuge der Gebietsreform in Bayern 1972 in die Gemeinde Eppishausen eingegliedert.